Polifiletik (eski Yunanca πολύς - çok sayıda ve φῦλον - kabile, klan), biyolojik taksonomide benzer özelliklere sahip, ancak farklı atalardan türeyen bir grup organizmayı belirtmek için kullanılan bir terimdir.
Polifiletik bir grup, ortak bir atadan miras almak yerine, yakınsak evrim yoluyla benzer özellikler kazanmış organizmaları içerir. Dolayısıyla polifiletik bir grup, farklı kökenlere sahip organizmaları birleştirir ve doğal bir grup olmaktan ziyade yapay bir gruptur.
Polifiliden farklı olarak, monofiletik bir grup, ortak bir atanın tüm torunlarını ve yalnızca onları içerir. Polifili, ilgisiz formları birleştirdiği için organizmaları sınıflandırırken istenmeyen bir durum olarak kabul edilir. Modern taksonomi yalnızca monofiletik grupları ayırma eğilimindedir.
Polifiletik gruplar, farklı kökenlere sahip olan ancak yine de bazı özellikler bakımından birbirine benzeyen organizma gruplarıdır. Hem hayvanlar hem de bitkiler olabilirler.
Biyolojide “polifiletik” terimi, ortak bir kökene sahip olan ancak birkaç gruba ayrılan bir grup organizmayı ifade etmek için kullanılır. Bu, sınıflandırmadaki hatalar nedeniyle veya bilim adamlarının bu organizmaların birbirleriyle nasıl ilişkili olduğunu tam olarak belirleyemediği durumlarda gerçekleşebilir.
Polifiletik grupların hem olumlu hem de olumsuz sonuçları olabilir. Örneğin, bir organizma grubunun ortak bir kökene ve benzer bir yapıya sahip olması, bilim adamlarının bu organizmaların birbirleriyle nasıl etkileşime girdiğini ve işleyişinin altında hangi mekanizmaların yattığını daha iyi anlamalarına yardımcı olabilir.
Bununla birlikte, eğer bir organizma grubu birden fazla polifiletik gruba ayrılırsa, bu durum kafa karışıklığına ve sınıflandırmada hatalara yol açabilir. Ayrıca polifiletik gruplar organizmaların evrimini ve birbirleriyle olan etkileşimlerini anlamayı zorlaştırabilir.
Bu nedenle, "polifiletik" terimi biyolojide farklı kökenlere sahip ancak bazı özellikler bakımından benzer olan organizma gruplarını ifade etmek için kullanılır ve organizmaların evrimi ve etkileşimlerinin incelenmesinde yararlı olabilir.
Nesne sınıflandırmasına yönelik polifinetik yaklaşım, gerçek filotik ilişkilerin taksonomistlerin tipik olarak hayal ettiğinden çok daha karmaşık olabileceğini savunan bir metodolojidir. Organizmaları kökenlerine ve ilişkilerine göre farklı monofiletik dallara veya gruplara bölmek yerine, polifiletik sınıflandırma, filotik oluşumun gerçekçi bir resmini göstermeyi amaçlamaktadır.