Буквално „ендогенни алергени“ са тези, които се намират в човешкото тяло. Те не са чужди, но реагират заедно с тялото ни. В човешкото тяло има много алергени. Ако имунната система работи правилно, тогава тя „знае как“ да ги разпознае и унищожи. Естествените пречки, създадени от имунната система, ни предпазват от опасни микроорганизми и предотвратяват навлизането на токсични вещества в кръвоносната система. Въпреки това, когато защитните сили са отслабени, тялото става податливо на сериозни заболявания.