Хранителната диспепсия обикновено засяга млади хора, но често и хора на средна възраст. Дългосрочно хронично възпаление на лигавицата на стомаха и дванадесетопръстника, стомашно кървене, булбит и гастрит могат да допринесат за диспептични симптоми. Възниква на фона на преструктурирането на чревната лигавица, което се случва по време на прехода от кърмене към хранене с плодови сокове и краве мляко, в повечето случаи атрофията на лигавицата бързо изчезва.