Fumagillin er et antibiotikum, der blev udviklet i 1960'erne til behandling af tuberkulose. Det blev opdaget af et hold videnskabsmænd fra University of Toronto ledet af Dr. William J. Farrar.
Fumagillin er udviklet baseret på et naturligt antibiotikum opnået fra svampen Fusarium solani. Denne svamp er blevet brugt til at producere antibiotika siden det 18. århundrede, men fumagillin var det første syntetiske antibiotikum, der blev bevist effektivt til behandling af tuberkulose.
Efter vellykkede forsøg på dyr begyndte fumagillin at blive brugt til mennesker. I 1970'erne blev det et af de mest populære antibiotika i verden. Men i 1981 blev det opdaget, at fumagillin kan forårsage alvorlige bivirkninger såsom allergiske reaktioner og leverskader.
I dag bruges fumagillin ikke i medicin på grund af dets høje toksicitet og lave effektivitet. Det er dog fortsat et objekt for videnskabelig forskning, da dets struktur stadig er kompleks og interessant at studere.