Fumagilline is een antibioticum dat in de jaren zestig werd ontwikkeld om tuberculose te behandelen. Het werd ontdekt door een team van wetenschappers van de Universiteit van Toronto onder leiding van Dr. William J. Farrar.
Fumagilline is ontwikkeld op basis van een natuurlijk antibioticum verkregen uit de schimmel Fusarium solani. Deze schimmel wordt al sinds de 18e eeuw gebruikt om antibiotica te produceren, maar fumagilline was het eerste synthetische antibioticum waarvan bewezen werd dat het effectief was bij de behandeling van tuberculose.
Na succesvolle tests bij dieren werd fumagilline bij mensen gebruikt. In de jaren zeventig werd het een van de meest populaire antibiotica ter wereld. In 1981 werd echter ontdekt dat fumagilline ernstige bijwerkingen kan veroorzaken, zoals allergische reacties en leverschade.
Tegenwoordig wordt fumagilline niet in de geneeskunde gebruikt vanwege de hoge toxiciteit en lage effectiviteit. Het blijft echter een object van wetenschappelijk onderzoek, omdat de structuur ervan nog steeds complex en interessant is om te bestuderen.