Fumagillin er et antibiotikum som ble utviklet på 1960-tallet for å behandle tuberkulose. Den ble oppdaget av et team av forskere fra University of Toronto ledet av Dr. William J. Farrar.
Fumagillin ble utviklet basert på et naturlig antibiotikum hentet fra soppen Fusarium solani. Denne soppen har blitt brukt til å produsere antibiotika siden 1700-tallet, men fumagillin var det første syntetiske antibiotikumet som ble bevist effektivt i behandling av tuberkulose.
Etter vellykket testing på dyr begynte fumagillin å bli brukt på mennesker. På 1970-tallet ble det en av de mest populære antibiotikaene i verden. I 1981 ble det imidlertid oppdaget at fumagillin kan forårsake alvorlige bivirkninger som allergiske reaksjoner og leverskade.
I dag brukes ikke fumagillin i medisin på grunn av dets høye toksisitet og lave effektivitet. Imidlertid fortsetter det å være et objekt for vitenskapelig forskning, siden strukturen fortsatt er kompleks og interessant å studere.