Northern Blot Analyse er en af de genekspressionsmetoder, der giver dig mulighed for at bestemme tilstedeværelsen og mængden af specifikke RNA'er i celler. Denne metode blev udviklet i 1977 og er opkaldt efter Southern Blot Analysis, som tidligere blev udviklet til at påvise specifikt DNA i celler.
Northern Blotting bruges til at identificere specifikke områder af messenger-RNA i celler. Denne metode er baseret på brugen af en genprobe designet til at detektere RNA'et af interesse. En genprobe er et kort stykke DNA mærket med en radioaktiv eller fluorescerende markør. Det bruges til at hybridisere til RNA, der er blevet adskilt efter størrelse og påført en membran.
For at udføre Northern blotting ekstraheres RNA først fra celler og adskilles efter størrelse ved hjælp af agarosegelelektroforese. RNA'et overføres derefter til en membran, hvor det fikseres og hybridiseres med genproben. Herefter undersøges membranen for tilstedeværelsen af et signal, der indikerer tilstedeværelsen af det ønskede RNA.
Northern blotting er et vigtigt værktøj til at studere genekspression og molekylære mekanismer, der ligger til grund for celleudvikling og funktion. Det giver os mulighed for at bestemme, hvilke gener der udtrykkes under visse forhold, og hvordan ændringer i genekspression er forbundet med forskellige sygdomme.
Som konklusion er Northern blotting en vigtig teknik til at studere genekspression og kan bruges i en bred vifte af undersøgelser relateret til cellebiologi, genetik og molekylærbiologi. Sammen med andre teknikker såsom Southern blotting og Western blotting hjælper det med at etablere forholdet mellem genprodukter og cellulære funktioner, et vigtigt skridt til yderligere forståelse af biologiske processer.
Northern blotting Northern blotting er en metode til påvisning af specifikke områder af messenger-RNA (mRNA) i celler, som er baseret på brugen af en probe til at påvise det ønskede RNA. Denne metode bruges til at analysere genekspression og er et alternativ til Southern blotting.
Princippet for Northern blot-metoden er som følger: en prøve af RNA isoleret fra celler behandles med nukleasen RNase III, som ødelægger mRNA'et og kun efterlader DNA-fragmenter. Disse DNA-fragmenter hybridiseres derefter med prober, som er oligonukleotider komplementære til visse områder af mRNA'et. Hybridisering sker i en agarosegel, som gør det muligt at adskille DNA-fragmenter efter deres størrelse. Efter hybridisering behandles gelen med en alkali, som ødelægger DNA'et og efterlader kun den probe, der er blevet hybridiseret til mRNA'et. Proben visualiseres derefter under anvendelse af et farvestof såsom radioaktivt thymidin eller et fluorescerende farvestof.
I modsætning til Southern og Western blotting giver Northern blotting-metoden dig mulighed for at analysere ikke kun protein, men også RNA. Dette er især vigtigt for genekspressionsundersøgelser, da mRNA er en forløber for protein. Derudover er Northern blotting mindre følsom over for størrelsen af det fragment, der undersøges, hvilket kan være nyttigt til at analysere længere områder af mRNA.
Northern blotting er meget udbredt i biologi, genetik og medicin til at bestemme genekspression i væv, cellelinjer og cellekulturer. Det kan identificere gener forbundet med forskellige sygdomme som kræft, diabetes, hjerte-kar-sygdomme osv.
Northern blot-analyse, også kendt som northern blotting, er en metode til at identificere specifikke steder i RNA-budbringermatrixen i kropsceller. Denne metode er afhængig af at introducere et gen, kaldet en probe, for at detektere det RNA, der kræves af prøven, der analyseres. For at sammenligne med de to andre metoder, Southern Blot og Western Blot, nævnt tidligere, er Southern Blot en mere generel metode, der tillader analyse af proteiner af enhver type, snarere end at være begrænset til RNA eller DNA. På den anden side er Western blotting designet til at adskille proteiner, mens Northern Blotting er designet til at analysere RNA