Polyphyly er et undersæt fænomen inden for evolutionsteori, der beskriver mange sekventielle adaptive ændringer af en organisme, der opstod som reaktion på den samme miljøfaktor, såsom en ændring i temperatur eller tryk, eller andet evolutionært øjeblik. Det var tidligere antaget, at adaptive ændringer i morfologi kun kunne forekomme én gang, og gentagne ændringer, hvis de forekom, kunne betragtes som afvigelser fra formens oprindelige principper. Men polyphyly forklarer, hvordan evolutionsteorien i lyset af udviklingsdata viser især de tætte genetiske og økologiske sammenhænge mellem forskellige evolutionære processer, herunder dem, der ikke er direkte adaptive, såsom ekspressionen af genetisk variation. Disse fænomener er ikke nødvendigvis skadelige eller farlige, men de er interessante og vigtige for udviklingen af evolutionær biologi.
I dag søger vi konstant efter de bedste måder at leve på vores planet. En af de største bekymringer er, at konkurrerende arter kan føre til økosystemsammenbrud og ubalance. Andre arter skal så konkurrere om det resterende ressourceareal, hvilket kan føre til reduceret økosystemresiliens og en højere risiko for katastrofale forstyrrelser og udryddelse.