Οι αεραγωγοί και οι πνεύμονες όχι μόνο εκτελούν τη λειτουργία του καθαρισμού και της διανομής του αέρα και της ανταλλαγής οξυγόνου για διοξείδιο του άνθρακα, αλλά παίζουν επίσης σημαντικό ρόλο στη διασφάλιση της κυτταρικής αναπνοής. Η αναλογία με την καύση και το «καύσιμο» είναι πολύ ακριβής, καθώς όπως μια φλόγα χρειάζεται οξυγόνο για να καεί, έτσι και τα κύτταρα χρειάζονται οξυγόνο για να μετατρέψουν τα θρεπτικά συστατικά των τροφίμων σε ενέργεια.
Η κυτταρική αναπνοή συμβαίνει σε κάθε κύτταρο του σώματός μας, στα μιτοχόνδριά του. Η ανταλλαγή οξυγόνου και διοξειδίου του άνθρακα μεταξύ των κυττάρων και των πνευμονικών κυψελίδων συμβαίνει με τον ίδιο τρόπο όπως μεταξύ των τριχοειδών αγγείων του αίματος και των πνευμονικών κυψελίδων. Η αιμοσφαιρίνη στα ερυθρά αιμοσφαίρια μεταφέρει οξυγόνο μέσω των αρτηριών και αυτό περνά στο κύτταρο, ενώ το κύτταρο δίνει το διοξείδιο του άνθρακα που έχει συσσωρεύσει στα ερυθρά αιμοσφαίρια. Αυτό το διοξείδιο του άνθρακα εισέρχεται στις πνευμονικές κυψελίδες μέσω των τριχοειδών αγγείων και των φλεβών και ο κύκλος τελειώνει.
Η κυτταρική αναπνοή είναι μια πολύπλοκη διαδικασία που περιλαμβάνει πολλές χημικές αντιδράσεις. Η διαδικασία της οξείδωσης των θρεπτικών ουσιών στα μιτοχόνδρια του κυττάρου απελευθερώνει την ενέργεια που είναι απαραίτητη για την εκτέλεση διαφόρων λειτουργιών του σώματος. Ωστόσο, για να συμβούν αυτές οι αντιδράσεις, τα κύτταρα πρέπει να λαμβάνουν αρκετό οξυγόνο.
Η κυτταρική αναπνοή μπορεί να χωριστεί σε τρία κύρια στάδια: γλυκόλυση, κύκλος Krebs και οξειδωτική φωσφορυλίωση. Η γλυκόλυση συμβαίνει στο κυτταρόπλασμα του κυττάρου και συνίσταται στην αποσύνθεση της γλυκόζης σε πυριβικό και στην απελευθέρωση μικρής ποσότητας ενέργειας με τη μορφή ATP. Ο κύκλος του Krebs συμβαίνει στα μιτοχόνδρια και αποτελείται από την οξείδωση του πυριβικού σε διοξείδιο του άνθρακα, το οποίο απελευθερώνει ακόμη περισσότερη ενέργεια με τη μορφή ATP. Η οξειδωτική φωσφορυλίωση είναι η διαδικασία που απελευθερώνει το μεγαλύτερο μέρος της ενέργειας με τη μορφή ATP.
Η κυτταρική αναπνοή είναι μια σημαντική διαδικασία για τη διατήρηση των ζωτικών λειτουργιών του σώματος. Η έλλειψη οξυγόνου ή άλλες διαταραχές σε αυτή τη διαδικασία μπορεί να οδηγήσει σε σοβαρές ασθένειες όπως υποξία ή οξέωση. Ως εκ τούτου, είναι πολύ σημαντικό να διατηρείται ένα υγιές αναπνευστικό σύστημα και να παρέχεται επαρκές οξυγόνο για την κυτταρική αναπνοή.