Η δυσεντερία είναι μια εντερική λοίμωξη που προκαλείται από διάφορα βακτηριακά παθογόνα. Ένα τέτοιο παθογόνο είναι ο βάκιλος της δυσεντερίας Flexner.
Το παθογόνο F. flexneri είναι ένα Gram-αρνητικό παθογόνο που έχει την ικανότητα να διασχίζει τον εντερικό φραγμό και να αποικίζει το εντερικό τοίχωμα. Μόλις εισέλθει στο σώμα, το μικρόβιο επηρεάζει τη βλεννογόνο μεμβράνη και προκαλεί το σχηματισμό φλεγμονωδών εστιών. Ένα άτομο που έχει μολυνθεί από δυσεντερία Flexner γίνεται μολυσματικό σε άλλους ακόμη και πριν από την έναρξη των κλινικών εκδηλώσεων