Dysenterie is een darminfectie die wordt veroorzaakt door verschillende bacteriële pathogenen. Eén zo'n ziekteverwekker is de Flexner-dysenteriebacil.
De ziekteverwekker F. flexneri is een gramnegatieve ziekteverwekker die het vermogen heeft de darmbarrière te passeren en de darmwand te koloniseren. Eenmaal in het lichaam beïnvloedt de microbe het slijmvlies en veroorzaakt de vorming van ontstekingshaarden. Een persoon die is geïnfecteerd met de dysenterie van Flexner, wordt zelfs vóór het begin van klinische manifestaties besmettelijk voor anderen