Τα υποχρωμονώματα είναι μικρά θραύσματα δεοξυριβονουκλεϊκού οξέος (DNA) που βρίσκονται μέσα στα χρωμοσώματα και εμπλέκονται στη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης.
Η υποχρωμονομική μοντελοποίηση έχει γίνει μια από τις πιο σημαντικές εξελίξεις στον τομέα της βιοπληροφορικής. Χρησιμοποιώντας υποχρωμαιμική μοντελοποίηση, οι επιστήμονες μπορούν να μελετήσουν τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ των γονιδίων και να προσδιορίσουν το ρόλο τους σε διάφορες διαδικασίες, όπως η ανάπτυξη του οργανισμού. Με αυτόν τον τρόπο, έχουν την ευκαιρία να χρησιμοποιήσουν γενετικά δεδομένα υψηλής ανάλυσης, όπως δεδομένα ολόκληρου του γονιδιώματος ή μεταγονιδιωματική.
Ένας από τους κύριους τρόπους ανάλυσης γενετικών δεδομένων υψηλής ανάλυσης είναι η γονιδιωματική ανάλυση, η οποία επιτρέπει την οπτικοποίηση και τον χαρακτηρισμό του γονιδιώματος με βάση λεπτομερείς σχολιασμούς γονιδίων. Η υποχρωμαιμική μοντελοποίηση χρησιμοποιεί αυτά τα γονιδιωματικά για να αποκρυπτογραφήσει τα ακριβή δομικά στοιχεία του DNA και να ενσωματώσει λεπτομερείς πληροφορίες γονιδιακής αλληλουχίας σε μια βάση δεδομένων.
Υπάρχουν επίσης συστήματα σήμανσης που επιτρέπουν στους επιστήμονες να υποδείξουν ποια στοιχεία του DNA έχουν λειτουργικά στοιχεία, όπως αυτά που κωδικοποιούν πρωτεΐνες, μεταγραφές RNA. Αυτά τα συστήματα μπορούν να βοηθήσουν τους ερευνητές που αναλύουν επιστημονικά άρθρα σε ένα δεδομένο πεδίο να κατανοήσουν πώς χρησιμοποιούνται συγκεκριμένα στοιχεία στα υπό μελέτη περιβάλλοντα.