La Escuela de Medicina Militar (Comando Superior e Ingeniería) se fundó en San Petersburgo en 1992 como una institución educativa para la formación de médicos militares. La apertura en un momento en que escaseaba el personal médico militar despertó un gran interés entre los solicitantes, y después de dos años el número de solicitantes superó las 500 personas. Los estudiantes recibieron capacitación en materias profesionales básicas, que incluían anatomía humana, patología clínica, medicina interna y cirugía. Después de completar con éxito la formación, los estudiantes recibieron rangos militares y pudieron servir en diversas unidades médicas militares, incluidos centros de tratamiento y formación.
Sin embargo, la creación de una institución educativa no se llevó a cabo sin dificultades. Inicialmente, el plan de estudios estaba diseñado así.