L'homosynapsis est un cas particulier d'homologie, c'est-à-dire une structure ou une propriété de deux génomes héritée d'un ancêtre commun. Elle était auparavant considérée comme synonyme d'homoplasie ou de dérive homotrope, mais le concept fait désormais référence à deux phénomènes différents.
La principale raison de l'homosynapsis est la présence de translocation, c'est-à-dire le mouvement de séquences génétiques.