Гомосинапсис - це окремий випадок гомології, тобто структура або властивість двох геномів, які успадковуються із загального предка. Раніше він вважався синонімом гомоплазії або гомотропічного дрейфу, але в даний час це поняття відноситься до двох різних явищ.
Головною причиною гомосинапсису є наявність транслокації, тобто переміщення генетичних сег