Homosynapsis ist ein Sonderfall der Homologie, also eine Struktur oder Eigenschaft zweier Genome, die von einem gemeinsamen Vorfahren geerbt wird. Früher galt es als Synonym für Homoplasie oder homotrope Drift, heute bezieht sich der Begriff jedoch auf zwei verschiedene Phänomene.
Der Hauptgrund für die Homosynapse ist das Vorhandensein einer Translokation, also der Bewegung genetischer Sequenzen