Az ekvivalens kodonok különböző összetételű kodonok, amelyek ugyanazon aminosav beépítését kódolják egy polipeptidláncba.
A genetikai kódban sok aminosavat egynél több kodon kódol. Például a leucin aminosavat hat különböző kodon kódolja: UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG. Ez a hat kodon egyenértékű, mert ugyanazt az aminosavat, a leucint írja elő.
Az ekvivalens kodonok létezése a genetikai kód degenerációjának köszönhető. A kóddegeneráció azt jelenti, hogy a kodonok száma (61) nagyobb, mint az általuk kódolt aminosavak száma (20).
Az ekvivalens kodonok jelenléte biológiai jelentőséggel bír. Először is, növeli a genetikai kód mutációkkal szembeni ellenállását. Másodszor, egy aminosavhoz különböző kodonok használata lehetővé teszi a transzláció hatékonyságának szabályozását.
Így az ekvivalens kodonok a degenerált genetikai kód kulcsfontosságú jellemzői, és fontos biológiai jelentőséggel bírnak.
A kodonok három nukleotid (tRNS), amelyek részt vesznek a polipeptid lánc aminosavainak kódolásában a fehérje bioszintézis során. A savak kodononként egy aminosavat tartalmaznak. Míg minden embernek húsz különböző aminosavból álló készlete van a fehérjék előállításához, ezek közül tíz aminosav képződhet egyetlen sav maradékaiból. Ahelyett, hogy tíz különböző kodont használnának a fehérjelánc tíz különböző aminosavának kódolására, a gének ekvivalens kodonokat használnak, amelyek az összes azonos összetételű aminosavat kódolják, így néhány kodont megtakarítanak