I codoni equivalenti sono codoni di diversa composizione che codificano l'inclusione dello stesso amminoacido in una catena polipeptidica.
Nel codice genetico, molti amminoacidi sono codificati da più di un codone. Ad esempio, l'amminoacido leucina è codificato da sei diversi codoni: UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG. Questi sei codoni sono equivalenti perché specificano l'inclusione dello stesso amminoacido, la leucina.
L'esistenza di codoni equivalenti è dovuta alla degenerazione del codice genetico. La degenerazione del codice significa che il numero di codoni (61) è maggiore del numero di amminoacidi che codificano (20).
La presenza di codoni equivalenti ha significato biologico. Innanzitutto aumenta la resistenza del codice genetico alle mutazioni. In secondo luogo, l'uso di codoni diversi per un amminoacido consente di regolare l'efficienza della traduzione.
Pertanto, i codoni equivalenti sono una caratteristica chiave del codice genetico degenerato e hanno un importante significato biologico.
I codoni sono tre nucleotidi (tRNA) coinvolti nella codifica degli amminoacidi in una catena polipeptidica durante la biosintesi delle proteine. Gli acidi includono un amminoacido per codone. Mentre ogni persona ha un insieme di venti diversi amminoacidi necessari per produrre le proteine, dieci di questi amminoacidi possono essere formati dai residui di un singolo acido. Invece di utilizzare dieci codoni diversi per codificare ciascuno dei dieci diversi amminoacidi in una catena proteica, i geni utilizzano codoni equivalenti che codificano per tutti i diversi amminoacidi con la stessa composizione, risparmiando alcuni codoni sulla catena proteica.