A zigotén a meiózis első profázisának második szakasza, amely során a homológ kromoszómák bivalenseket alkotnak. Ebben a szakaszban a homológ kromoszómák párosítása és szinapszisa következik be. A kromoszómák homológ régiói közelednek egymáshoz, és kétértékű komplexeket képeznek. A bivalens két szinaptikus homológ kromoszómából áll, amelyek a chiasmata régióban kapcsolódnak össze - a kromoszóma keresztezési területei. A zigotén során nagyszámú ilyen chiasma képződik. A kromoszómák szinapszisa a szinaptonemális komplex fehérjéinek részvételével történik. Így a zigotén hatására a homológ kromoszómák bivalensekké párosulnak, ami nagy jelentőséggel bír a későbbi átkelés és a kromoszóma szegregáció korrekciója szempontjából a meiózis első osztódásában.
A zigotén a meiózis első profázisának második szakasza, amely során a kromoszómafelosztásra való felkészülés fontos szakasza következik be. Ebben a szakaszban a homológ kromoszómák elkezdenek bivalenseket képezni, ami a meiózis kulcsfontosságú eseménye.
A zigotén alatt a homológoknak nevezett kromoszómapárok közeledni kezdenek egymáshoz, és egymással szemben sorakoznak fel. Ez egy szinaptonémának nevezett szerkezetet eredményez, amely a homológ kromoszómákat tartja össze. A szinaptonéma a szinaptonemális komplexeknek nevezett speciális fehérjéknek köszönhetően jön létre.
A bivalensek kialakulása a zigotén stádiumban nagy jelentőséggel bír a meiózis szempontjából, mivel ez biztosítja a genetikai információ pontos eloszlását a leánysejtek között. Mindegyik bivalens két kromoszómából áll, amelyek mindegyike más-más szülőktől származik. A meiózis folyamata során a bivalensek külön kromoszómákká válnak szét, amelyek aztán szétoszlanak a leánysejtek között.
A zigotén stádium azonban a genetikai információ elosztásának hibáinak kockázatát is rejtheti magában, ami genetikai rendellenességekhez és betegségekhez vezethet. Például a homológ kromoszómák eltolódása vagy a szinaptonéma törései kromoszómaeloszlási hibákhoz vezethetnek, ami rendellenes kromoszómaszámmal kapcsolatos szindrómákat (pl. Down-szindróma) okozhat.
Így a zigotén a meiózis egyik fontos szakasza, amely biztosítja a genetikai információ pontos eloszlását a leánysejtek között. Hangsúlyozza továbbá a meiózis megfelelő működésének fontosságát az emberi egészség szempontjából.
A zigotén az I. profázis második szakasza. A konjugáció következtében a testvérkromatidák centromerjeiken keresztül kapcsolódnak egymáshoz, morfológiailag homogén syndesmoszomális hiátust képezve. A bivalens centromereik keresztezése miatt jön létre. Az anya- és leánykromatidák relatív helyzetének változékonysága a zigotén számos formáját eredményezi.
A zigotént megelőzi az első stádium, a pachynema, amikor befejeződik a testvér monokromatida hurkok feloldása és a leánykromatidák képződnek. Ennek a szakasznak a végét a nukleáris burok megjelenése jelzi.
Az interkinézis során a mitotikus DNS-replikáció folytatódik. A „szülői” leánykromatidák csak egy példányt tartalmaznak az anyai kromoszómából (1n), a testvérleányok pedig kettőt. Az interkinézis az mRNS és fehérjerendszer segítségével a sejtciklus kezdetétől - a G1 állapottól a metafázisig - átszervezi a prokarióta genomot.