自然発生源の感染症は、人獣共通感染症であり、野生動物や鳥の間で循環し、それらから、または動物製品を介して人間に伝染する急性感染症のグループに属します。これらは、レプトスピラ症、オンコセルカ症、ダニ媒介回帰熱など、吸血媒介動物を介して動物から人間に伝播する人獣共通感染症(媒介媒介疾患)とは異なります。これらの感染症による感染は、特定の病原体ベクターまたは動物の宿主との接触を通じて起こり、感染を引き起こします。
人体への曝露が潜在的な危険となるのは、確認された症例のうち 20 ~ 30% のみです。たとえば、レプトスピラ症は人為感染症の 1 つであり、ロッキー山紅斑熱や犬ピロプラズマ症などのダニ媒介感染症の多くも含まれます。水域を訪れたり、水運に接触したり、埋め立て地で作業したりする場合、レプトスピラ症に感染するリスクが高まります。ペストや Q 熱は、郊外の住民、庭師、犬と接触する人々、ホームレスや劣悪な宿泊施設を訪れる他の集団でも発生する可能性があります。ツェリンナヤ村と水力発電所のある貯水池との境界にあるロストフ地域で狂犬病ウイルスの人人媒介性の発生が記録され、家畜や伐採者との接触が蔓延していた。患者は野良犬に噛まれた。人獣共通感染症のサイクルは、狂犬病、天然痘、野兎病、ブルセラ症ウイルスによって支えられています。アヒルのオウム病と動物のサルモネラ症は、伝染性の高い人虫によって引き起こされます。