Beenmerg (lat. medulla ossium) is het binnenste deel van het bot, bestaande uit los vezelig bindweefsel dat hematopoietische cellen bevat.
Het beenmerg vult de holte van de buisvormige botten en de cellen van de sponsachtige botten. Het bestaat uit vetweefsel, bloedvaten en zenuwen, evenals hematopoëtische cellen (erytroblasten, megakaryocyten, enz.).
De belangrijkste functie van beenmerg is hematopoëse. Hier vindt de vorming van rode bloedcellen, witte bloedcellen en bloedplaatjes plaats. Bovendien worden oude rode bloedcellen in het beenmerg vernietigd.
Beenmerg speelt een belangrijke rol in de metabolische processen van botweefsel en neemt deel aan het mineraalmetabolisme. Het is ook een vetdepot en heeft immunologische eigenschappen.