Mikroglej to rodzaj komórek glejowych, które pełnią funkcje odpornościowe i regulacyjne w ośrodkowym układzie nerwowym. Nazwa mikroglej pochodzi od greckich słów mikro i glia.
Mikroglej stanowi około 10-15% całkowitej liczby komórek mózgowych. Jest rozproszony po całym mózgu, tworząc sieć komórek, które stale skanują tkankę mózgową w poszukiwaniu patogenów, uszkodzeń lub „śmieci”. Po wykryciu jakichkolwiek nieprawidłowości mikroglej zostaje aktywowany, zwiększa swój rozmiar i zaczyna wydzielać różne związki, które albo wyzwalają odpowiedź immunologiczną, albo stymulują regenerację komórek nerwowych i odbudowę tkanki mózgowej.
Zatem mikroglej odgrywa kluczową rolę w utrzymaniu homeostazy i regeneracji ośrodkowego układu nerwowego. Zaburzenia w funkcjonowaniu tych komórek wiążą się z rozwojem chorób neurodegeneracyjnych i psychicznych.