Пачини Агостоно Теодосо е роден на 21 декември 1775 г. Баща му е известният лекар Карло Анджело Пачини, той продължава работата на баща си, ставайки анатом и публицист. В началото на кариерата си Пачини работи като учител по биология, но скоро осъзнава призванието си и става професор по ветеринарна медицина.