Вратата на инфекцията е входната дупка в макроорганизма, през която той влиза в контакт с патогенни микроорганизми или патогени, мигриращи през лимфните съдове. Едва след като влязат в тялото през входната врата, микробите се озовават на мястото на възможна репликация и се определя по-нататъшният им спектър на действие. Без входна врата инфекциозният процес може да възникне много локално и да има ограничени последствия за тялото. Водните безгръбначни и други животни използват симбиотични взаимоотношения с микробите, без да бъдат физиологично увредени от тях. Въпреки това, домакините, които се възползват от микробите, които живеят с тях, могат да бъдат застрашени, ако техните симбионти се развият твърде далеч от техните поведенчески модели. Голям брой фенотипно различни микро