Η πύλη της μόλυνσης είναι η οπή εισόδου στον μακροοργανισμό μέσω της οποίας έρχεται σε επαφή με παθογόνους μικροοργανισμούς ή παθογόνα που μεταναστεύουν μέσω των λεμφικών αγγείων. Μόνο αφού εισέλθουν στο σώμα μέσω της πύλης εισόδου, τα μικρόβια βρίσκονται στη θέση πιθανής αντιγραφής και προσδιορίζεται το περαιτέρω φάσμα δράσης τους. Χωρίς πύλη εισόδου, η μολυσματική διαδικασία μπορεί να εμφανιστεί πολύ τοπικά και να έχει περιορισμένες συνέπειες για τον οργανισμό. Τα υδρόβια ασπόνδυλα και άλλα ζώα χρησιμοποιούν συμβιωτικές σχέσεις με μικρόβια χωρίς να βλάπτονται φυσιολογικά από αυτά. Ωστόσο, οι ξενιστές που επωφελούνται από τα μικρόβια που ζουν μαζί τους μπορεί να απειληθούν εάν τα συμβίωσή τους εξελιχθούν πολύ μακριά από τα πρότυπα συμπεριφοράς τους. Ένας μεγάλος αριθμός φαινοτυπικά διαφορετικών μικρο