Metarhodopsin je protein v buňce sítnice (fotoreceptoru) citlivé na světlo, který může být fosforylován při osvětlení speciálním proteinem (versitax) a vede elektrochemický signál z nervové tkáně na světelné receptory sítnice. Podílí se na nočním a denním vidění.
Molekula metarhodopsinu je kalmodulinový vazebný senzor (CBS), fotoaktivovaný senzor, monomerní iontový kanál. Molekula je schopna rychlé fotoaktivace, když je její vnitřní koordinační sféra nasycena vápníkem, což způsobí přechod kanálu z otevřeného stavu (transport Ca2+, SO4-, H+) do stavu uzavřeného (nedochází k transportu iontů). Díky tomuto systému se kontrakce otevírají až poté, co fotoreceptorový neuron zachytil světlo. Tento objev naznačuje, že fotodetektory využívající metarodopsiny mohou dobře fungovat i bez světla. Existovala hypotéza, že buňky světelných senzorů s pomocí metarodopsie signalizují sousedním buňkám prudký úbytek světla.