Metarhodopsin ist ein Protein in der lichtempfindlichen Netzhautzelle (Photorezeptor) des Auges, das bei Beleuchtung durch ein spezielles Protein (Versitax) phosphoryliert werden kann und ein elektrochemisches Signal vom Nervengewebe an die Lichtrezeptoren der Netzhaut weiterleitet. Es ist an der Tag- und Nachtsicht beteiligt.
Das Metarhodopsin-Molekül ist ein Calmodulin-Bindungssensor (CBS), ein photoaktivierter Sensor, ein Monomer-Ionenkanal. Das Molekül ist zu einer schnellen Photoaktivierung fähig, wenn seine interne Koordinationssphäre mit Kalzium gesättigt ist, was dazu führt, dass der Kanal von einem offenen Zustand (Transport von Ca2+, SO4-, H+) in einen geschlossenen Zustand (Transport von Ionen findet nicht statt) wechselt. Dank dieses Systems öffnen sich Kontraktionen erst, nachdem Licht von einem Photorezeptorneuron erkannt wurde. Diese Entdeckung legt nahe, dass Fotodetektoren, die Metarhodopsine verwenden, auch ohne Licht gut funktionieren können. Es gab eine Hypothese, dass Lichtsensorzellen mit Hilfe von Metarhodopsis benachbarten Zellen einen starken Lichtverlust signalisieren.