Axiální komplex počátků v strunatcích se zpočátku nachází na laterální straně těla (laterální mezoderm), poté se přesouvá do těla (ventrální ploténka) a nakonec končí na jeho dorzální (dorzální) části. Pro výraz „axiální kostra“ jsou povoleny následující synonymní názvy: axiální kosterní systém, rudimentární axiální skelet a muskuloskeletální axiální tyč. V následujícím budeme používat druhý termín.
Současně se objevuje cévní síť: první krevní trubice, pak větší cévy, z nichž většina jde do trupu, přesněji do proboscis - hlavových ledvin. První mozek (mozkový váček, mozkový vak) je vytvořen laterálně od axiálního komplexu, mediálně od něj jsou umístěny rudimentární smyslové orgány (jako oko, čočka, ucho, čichové váčky atd.). Primitivní ústa, zprvu nepárová, se tvoří v místě prvního mozku, ve stejné rovině s ním a pod proboscis, tzn. za středem kostry axiální tyče. Brzy získá pár. Rozměry všech tří očí jsou poloviční šířky hlavy; pouze horní oko je větší
Axiální komplex rudimentu (axiální kostra, resp. axiální vak) je soubor rudimentů periferního nervového systému a kosterních rudimentů, které se u embryí strunatců nacházejí na dorzální (dorzální) straně těla. Struktura axiálního komplexu může být použita ke studiu evoluce zvířat a vývoje hlavních tělesných systémů.
Axiální komplex zajišťuje pohyblivost a stabilitu těla a podílí se také na tvorbě důležitých orgánů a systémů těla, jako jsou nervy, svaly, šlachy, kosti a klouby.