Pupek je jizva, která zůstala v místě, kde se pupeční šňůra připojila k plodu během vývoje plodu.
Pupeční šňůra spojuje vyvíjející se plod s placentou, přes kterou dostává výživu a kyslík od matky. Je připevněn k břišní stěně plodu v oblasti budoucího pupku.
Po narození dítěte se pupeční šňůra utáhne a přestřihne. Místo, kde se pupeční šňůra uchytí na kůži, se změní v pupeční pahýl, který se časem změní v pupeční jizvu – pupík.
Pupek se nachází ve středu břicha. Jedná se o oblast kůže o průměru asi 1 cm, která je vůči okolnímu povrchu mírně stlačena.
Pupek je tedy přirozenou jizvou, která připomíná prenatální období lidského života. Je přítomna po celý život.