Plicní sepse probíhá téměř stejně jako septikémie, ale do procesu jsou zapojeny plíce a vzniká převážně ložiskový hnisavý zánět typu alveolitidy. Důležitým rozdílem mezi plicní formou sepse a septikémií je výrazné zvýšení tělesné teploty, bolesti hlavy, tachykardie, hypotenze