De indre kønsorganer er en gruppe af organer, der omfatter mandlige og kvindelige kønsorganer. De er placeret inde i kroppen og udfører vigtige funktioner relateret til reproduktion.
De mandlige reproduktive organer omfatter penis, pung, prostata og sædblærer. Penis er hoveddelen af det mandlige reproduktionsapparat og er en forlængelse af penis. Den har et hoved, en krop og en rod, som er placeret på skambenet. Pungen er den sæk, der huser testiklerne og producerer sædceller. Testiklerne producerer sædceller, som er med til at befrugte ægget og skabe et nyt liv. Prostatakirtlen er placeret bag blæren og styrer urinproduktionen. Sædblærerne syntetiserer sædceller til overførsel under samleje.
De kvindelige reproduktionsorganer er livmoderen, æggestokkene, æggelederne og skeden. Livmoderen er det vigtigste reproduktive organ, hvor æg modnes. Æggestokkene er parrede kirtler, der producerer æg, hvorefter de bevæger sig ind i æggelederen gennem ægløsning. Æggelederen er den vigtigste funktionelle endedel af systemet, der transporterer ægget fra æggestokkene efter ægløsning til livmoderhulen, hvor det kan befrugtes af sæd. Skeden indeholder livmoderhalskanalerne