De indre kjønnsorganene er en gruppe organer som inkluderer mannlige og kvinnelige kjønnsorganer. De er plassert inne i kroppen og utfører viktige funksjoner knyttet til reproduksjon.
De mannlige reproduksjonsorganene inkluderer penis, pungen, prostatakjertelen og sædblærene. Penis er hoveddelen av det mannlige reproduksjonsapparatet og er en forlengelse av penis. Den har et hode, en kropp og en rot, som ligger på kjønnsbeinet. Pungen er sekken som huser testiklene og produserer sædceller. Testiklene produserer sædceller, som er med på å befrukte egget og skape et nytt liv. Prostatakjertelen ligger bak blæren og kontrollerer urinproduksjonen. Sædblærene syntetiserer sædceller for overføring under samleie.
De kvinnelige reproduktive organene er livmoren, eggstokkene, egglederne og skjeden. Livmoren er det viktigste reproduktive organet der egg modnes. Eggstokkene er parede kjertler som produserer egg, hvoretter de beveger seg inn i egglederen gjennom eggløsning. Egglederen er den viktigste funksjonelle endedelen av systemet, og transporterer egget fra eggstokkene etter eggløsning til livmorhulen, hvor det kan befruktes av sæd. Skjeden inneholder livmorhalskanalene