Η φυλογένεση είναι η διαδικασία ιστορικής ανάπτυξης της ζωντανής φύσης και των επιμέρους ομάδων των οργανισμών που την αποτελούν. Η επιστημονική βάση για τις ιδέες για τη φυλογένεση είναι η θεωρία της εξέλιξης που δημιουργήθηκε από τον Κάρολο Δαρβίνο.
Ο κλάδος της βιολογίας που μελετά τη φυλογένεση και τα πρότυπα της ονομάζεται φυλογενετική. Μελετά την προέλευση των σύγχρονων μορφών από προγόνους προγόνους, καθώς και τους λόγους που καθορίζουν την πορεία της εξέλιξής τους, τους νόμους αυτής της εξέλιξης κ.λπ.
Σχηματικά, η φυλογένεση των ζώων και των φυτών αναπαρίσταται συνήθως με τη μορφή ενός λεγόμενου οικογενειακού δέντρου. Ο κορμός του αντιστοιχεί στις αρχικές μορφές ζωής και τα κλαδιά του αντιστοιχούν σε όλες τις επόμενες πολυάριθμες και όλο και πιο περίπλοκες μορφές.
Η φυλογένεση πρέπει να εξετάζεται σε ενότητα και αλληλεξάρτηση με την ανάπτυξη ενός ατόμου, δηλαδή την οντογένεση.
Η φυλογενετική περίοδος είναι ένα από τα πιο ενδιαφέροντα και συναρπαστικά στάδια στην εξέλιξη της ζωής στη Γη. Αυτό το φαινόμενο περιγράφει τη διαδικασία σχηματισμού κοινών χαρακτηριστικών σε ζωντανούς οργανισμούς με βάση τη γενετική συνέχεια. Οι φυλογενετικές διεργασίες οδηγούν στην εμφάνιση νέων ειδών, ομάδων και οικογενειών ζωντανών οργανισμών λόγω της σταδιακής προσαρμογής στις μεταβαλλόμενες περιβαλλοντικές συνθήκες.
Κατά τη φυλογενετική περίοδο συμβαίνουν αλλαγές στη δομή και τη λειτουργία των ζωντανών οργανισμών, οι οποίες είναι αποτέλεσμα ενός συνδυασμού κληρονομικών χαρακτηριστικών από προηγούμενες γενιές. Αρχικά