Τα αιθέρια έλαια πρέπει να φυλάσσονται σε δροσερό, ξηρό μέρος, μακριά από παιδιά, προστατευμένο από το φως, σε γυάλινες φιάλες με κλειστό καπάκι, σε θερμοκρασία όχι χαμηλότερη από 0° και όχι μεγαλύτερη από 30°C. Ελάχιστη διάρκεια ζωής 3 χρόνια. Εάν ένα αιθέριο έλαιο λαμβάνεται χωρίς να παραβιάζεται η τεχνολογία από εξαιρετικές πρώτες ύλες, τότε με την πάροδο του χρόνου, όπως το καλό κρασί, η ποιότητά του βελτιώνεται αισθητά, πράγμα που σημαίνει ότι αυξάνεται η διάρκεια ζωής του (λιβάνι, πατσουλί, τριαντάφυλλο, σανταλόξυλο).
Τα έλαια που λαμβάνονται από τα εσπεριδοειδή, καθώς και το πεύκο, φυλάσσονται καλύτερα στο ψυγείο, καθώς οξειδώνονται γρήγορα. Διάρκεια ζωής 1 έτος.
Προσοχή! Τα αιθέρια έλαια είναι εύφλεκτα υγρά.