Mesosaprofyytit (kreikan sanasta mesos - keski + sapros - mätä) ovat heterotrofisia bakteereja, jotka hapettavat kasviperäisiä orgaanisia aineita, neuogeenien ja fakultatiivisten aerobisten autotrofien välissä. Mesosaprobiontit ovat yleisiä hyvin ilmastoiduissa vesistöissä (joet, järvet, louhokset), joissa tapahtuu jonkin verran veden sekoittumista. Nämä ovat organismeja, joilla on melko monimutkainen aineenvaihduntaaktiivisuus, minkä ansiosta ne voivat saada suurelta osin elintärkeitä resursseja sellaisten organismien biomassasta, joiden substraattien saatavuus on tiukasti rajoitettu (toisin kuin autotrofit, joita nykyiset vesiolosuhteet eivät juuri rajoita). Termi "mesosarobiont" korostaa ennen kaikkea merkittävää suhdetta vesiteollisuuden elämään, jossa mikro-organismit muodostavat suuria yhteisöjä, jotka fermentoivat hydrobiologista jätettä, jota ei käytännössä voida luokitella tiukan määritelmän mukaisiksi autotrofeiksi tai heterotrofeiksi. Pohjimmiltaan tämä termi on eräänlainen kompromissi organismien kerrostumisen välillä suhteessa energialähteeseen ja substraattiin sekä roolin välillä vedessä elävän pohjaeliöstön toteuttamisessa ja sen kauttakulkutilanteessa. Ns. pakolliset heterotrofit, jotka käyttävät saatavilla olevia elinympäristöjä (pohjasedimentit, kivet, avoimet