La charge de mutation est un terme souvent utilisé en génétique et en biologie évolutive pour désigner la complexité et l'intensité des événements de mutation survenant dans une population. Ce terme peut être utilisé à la fois pour décrire la charge adaptative, c'est-à-dire le potentiel évolutif d'un certain génotype, et pour décrire une mutation de stress pouvant conduire à une perturbation de la stabilité du système génétique.
Lorsqu’on considère la charge mutationnelle adaptative, le terme fait référence à la complexité résultant de la présence de multiples mutations par unité de temps. Cela souligne la nécessité d'optimiser les systèmes génétiques, car chaque mutation porte le potentiel de survie de l'organisme à un nouveau niveau et crée également un potentiel de mutations dans d'autres gènes.