Mutasjonsbelastning er et begrep som ofte brukes i genetikk og evolusjonsbiologi for å referere til kompleksiteten og intensiteten av mutasjonshendelser som forekommer i en populasjon. Dette begrepet kan brukes både for å beskrive den adaptive belastningen, det vil si det evolusjonære potensialet til en viss genotype, og for å beskrive en stressmutasjon som kan føre til forstyrrelse av stabiliteten til det genetiske systemet.
Når man vurderer adaptiv mutasjonsbelastning, refererer begrepet til kompleksiteten som følge av tilstedeværelsen av flere mutasjoner per tidsenhet. Dette understreker behovet for å optimalisere genetiske systemer, siden hver mutasjon bærer organismens overlevelsespotensial til et nytt nivå, og også skaper potensialet for mutasjoner i andre gener