Nama gonokromosom berasal dari kata Yunani:
γόνος - gonos (tanduk, jantan);
τόμος - tomos (garis, utas; bagikan). Dalam satu inti eukariotik terdapat banyak megakinase gonad-hemikaryon, yang meliputi kromosom supramal-postmarginal homolog (apo-to) dari banyak orang tua dan keturunan dari orang tua gonos.