Il nome gonocromosoma deriva dalle parole greche:
γόνος - gonos (corno, maschio);
τόμος - tomos (linea, filo; condivisione). In un nucleo eucariotico ci sono molte megachinasi gonade-hemikaryon, che includono cromosomi omologhi sopramali-postmarginali (apo-to) di molti genitori e discendenti dei genitori gonos.