De naam gonochromosoom komt van de Griekse woorden:
γόνος - gonos (hoorn, mannelijk);
τόμος - tomos (lijn, draad; delen). In één eukaryote kern bevinden zich veel gonade-hemikaryon-megakinasen, waaronder homologe supramale-postmarginale chromosomen (apo-to) van veel ouders en nakomelingen van de gono-ouders.