Filogeni adalah sejarah evolusi lengkap sekelompok organisme. Ini adalah ilmu yang mempelajari asal usul dan hubungan kelompok taksonomi dari tingkatan apa pun.
Studi filogenetik memungkinkan kita menelusuri perkembangan dan evolusi organisme dari nenek moyangnya. Untuk membangun pohon filogenetik, digunakan data dari perbandingan morfologi, embriologi, paleontologi, genetika dan disiplin ilmu lainnya. Analisis hubungan evolusi penting untuk taksonomi, karena memungkinkan untuk mengidentifikasi tingkat hubungan antara taksa yang berbeda.
Dengan demikian, filogeni memungkinkan kita memperoleh gambaran tentang jalur perkembangan evolusi organisme hidup dan merekonstruksi perkembangan sejarahnya dari nenek moyang yang sama hingga keadaan modern. Pengetahuan ini diperlukan untuk memahami mekanisme evolusi dan keanekaragaman hayati di planet kita.