Filogeni, bir grup organizmanın tam evrimsel tarihidir. Bu, herhangi bir seviyedeki taksonomik grupların kökenini ve ilişkilerini inceleyen bir bilimdir.
Filogenetik çalışmalar, organizmaların atalarından itibaren gelişimini ve evrimini izlememize olanak sağlar. Filogenetik ağaçları oluşturmak için karşılaştırmalı morfoloji, embriyoloji, paleontoloji, genetik ve diğer disiplinlerden elde edilen veriler kullanılır. Evrimsel ilişkilerin analizi, farklı taksonlar arasındaki ilişkinin derecesinin belirlenmesini mümkün kıldığından taksonomi için önemlidir.
Böylece filogeni, canlı organizmaların evrimsel gelişim yolları hakkında fikir edinmemizi ve ortak atadan modern devlete kadar tarihsel gelişimlerini yeniden yapılandırmamızı sağlar. Bu bilgi gezegenimizdeki evrim mekanizmalarını ve biyolojik çeşitliliği anlamak için gereklidir.