Филогенезата е пълната еволюционна история на група организми. Това е наука, която изучава произхода и връзките на таксономични групи от всякакъв ранг.
Филогенетичните изследвания ни позволяват да проследим развитието и еволюцията на организмите от техните предци. За изграждането на филогенетични дървета се използват данни от сравнителната морфология, ембриологията, палеонтологията, генетиката и други дисциплини. Анализът на еволюционните връзки е важен за таксономията, тъй като дава възможност да се идентифицира степента на връзка между различните таксони.
По този начин филогенезата ни позволява да добием представа за пътищата на еволюционното развитие на живите организми и да реконструираме тяхното историческо развитие от общ прародител до съвременното състояние. Това знание е необходимо, за да разберем механизмите на еволюцията и биологичното разнообразие на нашата планета.