Suatu iritan yang menyebabkan suatu penyakit disebut patogen (Yunani “pathos” - penyakit, “genesis” - asal). Patogen adalah agen penyebab penyakit, termasuk agen bakteri dan virus. Agen dan penyakit menular ditulis dalam kamus penyakit menular atau “infeksi” [1,2].
Dari definisi tersebut dapat disimpulkan bahwa mikroorganisme patogen dapat menyebabkan penyakit pada siapa saja: orang yang terinfeksi, orang yang sudah sembuh dari penyakitnya, atau orang yang tidak menderita penyakit. Manifestasi umum dari aktivitas patogen adalah kemampuan patogen untuk menembus sel inang melalui metabolisme (pelepasan zat aktif biologis), suntikan atau pengaruh lain, di mana ia mulai berkembang biak dengan cepat. Kehadiran parasit dan penyakit yang ditimbulkannya terus memberikan dampak negatif terhadap hewan dan manusia. Dengan berinteraksi dengan sel sehat, koloni bakteri menginfeksinya, menjadi bagian dari satu biosistem tubuh [3]. Contoh mikroorganisme patogen : - pneumococcus Strept