Alergenem pyłkowym jest białko wytwarzane przez rośliny w okresie kwitnienia. Jest to mikroskopijne ziarno pyłku składające się z białkowej otoczki i dziedzicznej informacji – samego alergenu. Pyłek uwalniany z rośliny kwitnącej do powietrza jest przenoszony przez wiatr. Właściwości alergizujące alergenu pyłkowego mają daleko idące konsekwencje, gdyż część pyłku kwiatowego osadza się nie tylko na samych kwiatach, ale także na skórze, odzieży, sierści zwierząt domowych i rozprzestrzenia się po całym domu. Alergeny pyłkowe są częstym składnikiem alergennym kurzu domowego. Potencjał alergenny alergenu pyłkowego jest bezpośrednio powiązany z zawartością określonej ilości białek. Niektóre rośliny są bardzo wrażliwe na pyłki alergenne czynników fizycznych, inne natomiast są w stanie wytrzymać te same lub bardziej agresywne warunki środowiskowe. Ponieważ immunoglobuliny G i E reagują na specyficzne białka w ziarnach pyłku roślin uczulających, może wystąpić nadwrażliwość krzyżowa pomiędzy alergenami pyłków i odpowiadającymi im białkami roślinnymi. Zjawisko to jest szczególnie widoczne w przypadku roślin zbożowych – u wielu pacjentów alergiczny pyłek zbóż może być mylony z katarem siennym. Drapanie, egzema, przekrwienie powiek