Przestrzeń międzynabłonkowa (łac. spatium interepiteliale) to niewielka ilość wolnej przestrzeni zlokalizowana pomiędzy szczelinowymi kanałami końcowymi gruczołu i pokrywająca powierzchniową warstwę nabłonkową w tkankach i narządach wielu zwierząt i ludzi.
Przestrzenie międzynabłonkowe powstają w wyniku nierównomiernego odkładania się wydzieliny w pęcherzykach gruczołów zewnątrzwydzielniczych. W patologiach przewodu żołądkowo-jelitowego odgrywają one ważną rolę w występowaniu wysięku mezenchymalnego do jamy brzusznej. Tworzenie wolnego płynu międzynabłonkowego występuje również podczas zapalenia narządów laminowanych i gruczołowych - dróg żółciowych i pęcherza. Najczęściej informacje o przestrzeniach międzynabłonkowych można znaleźć w medycynie przy opisie choroby takiej jak zapalenie trzustki. Jeśli płyn śródmiąższowy w trzustce nie zostanie zdiagnozowany lub leczony w odpowiednim czasie, pojawia się wiele powikłań, które znacznie komplikują życie pacjenta. Najczęściej, oprócz ogólnych objawów zatrucia, osoba skarży się na ból w okolicy brzucha, zwłaszcza w prawym podżebrzu. Wynika to z bezpośredniego wzrostu tkanki gruczołowej, a także przemieszczenia przepony z powodu gromadzenia się płynu. Ten rodzaj bólu jest silny i rozdzierający i zawsze pojawia się nagle. Leczenie wymaga natychmiastowej interwencji lekarskiej.