Genetik denge, bir popülasyondaki alel dağılımının nesilden nesile (seçim veya mutasyon olmadığında) sabit kaldığı bir durumdur.
Bir popülasyondaki alel frekansları zaman içinde değişmediğinde genetik denge sağlanır. Bu, doğal seçilim, mutasyon, genetik sürüklenme ve göç gibi evrimsel güçlerin birbirini dengelediği durumlarda ortaya çıkar.
Örneğin A aleli %60, a - aleli %40 sıklıkta ortaya çıkıyorsa ve bu frekanslar nesilden nesile korunuyorsa bu lokustaki popülasyonda genetik denge oluşmuştur.
Genetik denge popülasyon genetiğinde önemli bir kavramdır. Bir popülasyondaki alellerin ve genotiplerin sıklığının zaman içinde nasıl değişeceğini tahmin etmenizi sağlar. Dengesizlik popülasyonda evrimsel değişikliklere yol açar.