Granülomatöz kolanjit safra kesesini, safra kanallarını ve diğer karın organlarını etkileyebilen nadir bir bulaşıcı hastalıktır. Bu hastalık, safra kanallarının duvarlarına zarar verebilecek bakteri, virüs ve mantar gibi mikrobiyal ajanların uzun süreli ve yoğun saldırısının sonucudur. Kolanjit hastanın yaşamını tehdit ettiğinden hastalığın erken dönemde tanınması tedavi açısından büyük önem taşımaktadır.
Kolanjit bakteri, mantar ve viral enfeksiyonlar dahil olmak üzere çeşitli mikroorganizmalardan kaynaklanabilir. Ancak en yaygın patojenler bağırsak ailesindeki bakterilerdir. Bakteriler safraya kan ve mide mukozası yoluyla girerek safra kanallarının duvarlarında iltihaplanmaya ve granülom oluşumuna neden olur. Bakteriler, safra kanallarının duvarlarına zarar veren, yara izi ve doku sertleşmesine neden olan ve safra kanallarının tıkanmasına yol açan maddeler üreten toksinler ve atık ürünler üretir. Granül oluşumu nedeniyle tümör gelişmesi de mümkündür.
Granülomatöz kolanjit gelişimi için risk faktörleri arasında uzun süreli kolelitiazis, kronik obstrüktif karaciğer hastalığı bulunur.