Bakterial landşaft müəyyən ekoloji mühitdə mikroorqanizmlərin müxtəlifliyini təsvir edən anlayışdır. Bu, orqanizmlərin həyat fəaliyyətinin və onların ətraf mühitlə qarşılıqlı əlaqəsinin öyrənilməsinin mühüm aspektidir.
Mikroflora dedikdə, müxtəlif bioloji mühitlərdə yaşayan müxtəlif növ bakteriyaların birlikləri nəzərdə tutulur. Yaşayış yerlərindən asılı olaraq mikroorqanizmlər müxtəlif sayda və növlərin tərkibinə malik ola bilər. Məsələn, torpaqda bir çox növ göbələk, mikroorqanizm və faydalı bakteriyalar ola bilər, qidada isə yalnız bağırsaq cinsindən olan bakteriyalar mümkündür. İnsan bədənində yaşayan bakteriyalar orqanizmə faydalı ola bilər, məsələn, E.coli-nin bəzi növləri. İnsanın immun sistemi zəiflədikdə müxtəlif xəstəliklər də törədə bilirlər. İnsan orqanizminin öz mikroorqanizmləri var, onlar həmişə müəyyən balansda mövcuddur. Xarici mikroorqanizmlərin artan fəaliyyəti ilə bir balanssızlıq meydana gəlir. Bundan əlavə, qidalanma və fiziki fəaliyyət mikrofloranın balansına təsir göstərir: piylənmə, şəkərli diabet və s. ilə əlaqəli xəstəliklər mikrofloranın şərtlərinin və tərkibinin düzəldilməsini tələb edir. Bakterioloqlar mikrofloranı müxtəlif növ antibiotiklərə qarşı müqavimətini müəyyən etmək üçün öyrənirlər ki, bu da onlardan bu tip mikroblarla əlaqəli xəstəliklərin daha effektiv müalicəsi üçün istifadə etməyə imkan verir. Buna misal olaraq, bu tip bakteriyaların yaratdığı irinli abseslərin və ya dərin septik təzahürlərin törədicisi olan stafilokokkları göstərmək olar. Stafilokoklar normal insan mikroflorasında mövcuddur, lakin yaradan bədənə daxil olan hallar var. Stafilokokun törədicini müəyyən etmək üçün qida mühitində qan testi və mədəniyyət aparmaq lazımdır. Bundan sonra antibiotik müalicəsi təyin olunur, çünki düzgün təyin edilmədikdə stafilokok infeksiyaları ölümcül ola bilər.