Bakteriální krajina je pojem, který popisuje rozmanitost mikroorganismů v určitém ekologickém prostředí. To je důležitý aspekt studia životní aktivity organismů a jejich interakce s prostředím.
Mikroflóra označuje společenství bakterií různých druhů, které žijí v různých biologických prostředích. V závislosti na jejich stanovišti mohou mít mikroorganismy různý počet a složení druhů. Například v půdě může být přítomno mnoho druhů hub, mikroorganismů a prospěšných bakterií, zatímco v potravinách jsou možné pouze bakterie z rodu střev. Bakterie, které žijí v lidském těle, mohou být pro tělo prospěšné, například některé druhy E. coli. Mohou také způsobit různá onemocnění, když je narušený imunitní systém člověka. Lidské tělo má své vlastní mikroorganismy, které vždy existují v určité rovnováze. K nerovnováze dochází při zvýšené aktivitě cizích mikroorganismů. Výživa a fyzická aktivita navíc ovlivňují rovnováhu mikroflóry: onemocnění spojená s obezitou, cukrovkou atd. vyžadují korekci podmínek a složení mikroflóry. Bakteriologové studují mikroflóru, aby určili její odolnost vůči různým typům antibiotik, což umožňuje jejich použití pro účinnější léčbu onemocnění spojených s tímto typem mikrobů. Jedním z příkladů je stafylokok, který je původcem hnisavých abscesů nebo hlubokých septických projevů způsobených tímto typem bakterií. Stafylokoky jsou přítomny v normální lidské mikroflóře, ale existují případy, kdy se do těla dostanou z rány. K identifikaci původce stafylokoka je nutné provést krevní test a kultivaci na živném médiu. Poté je předepsána léčba antibiotiky, protože stafylokokové infekce mohou být smrtelné, pokud nejsou správně předepsány terapie.